Depende de cuales sean los objetivos. Si deseas quemar grasa es mejor entrenar en ayunas, ya que el organismo no tiene reservas energéticas extraídas de los alimentos y utiliza la grasa como principal fuente de enegía.
Si lo que quieres es tonificar, aumentar de peso/masa muscular/resistencia, mantenerte en forma, etc... pero no te interesa perder peso/grasa, entonces es imprescindible que ingieras almenos 1gr de carbohidratos de índice glucémico bajo por cada kg de peso corporal antes de tu entrenamiento.
PD: Si tratas de hacer entrenamientos intensos en ayunas te arriesgas a desfallecer, perder energía, marearte o lesionarte.