No encuentro relación entre que un producto sea transgénico y que se utilicen más plaguicidas, insecticidas, etc. Es más, muchos productos se hacen transgénicos precisamente para que resistan plagas sin necesidad de productos químicos.
Además, aunque un producto sea natural, se utilizan igualmente productos químicos, y no en menor medida por ser natural (sino más bien, como digo, al contrario). Personalmente no veo mayor problema en el uso de transgénicos. ¿Qué desventajas les veis?