Yo creo que es por la novedad. Mira, yo tengo seis gatos y dos perros y todos pasaron por lo mismo: los bufidos, los gruñidos los "quítate de encima de mi mamá" etc etc-
Enséñale al recién llegado a respetar al otro y proporcionale al de 6 años un refugio donde se pueda meter cuando se harte del otro. En mi caso, tengo un transportín atlas car con una cortina y cuando el chico se pone pesado, el otro se mete a dormir en su refugio.
También es comprensible que la perra que ya tenías en casa se acojone cuando se vea encima a la de 11 kilos, que encima es cachorro, que sólo quiere jugar. En mi caso yo acabo de meter en casa uno de apenas dos años que pesa dos kilos como mucho con uno de cuatro años que pesa 13 kg. El mayor sólo quiere tranquilidad y el chico solo quiere jugar a lo bestia. Lo que pasa es que como en mi caso el de mayor tamaño es el que quiere dormir y estar tranquilo, cuando el otro se pasa lo pone en su sitio echándole un broncazo a ladridos.
En fin, terminarán por aceptarse pero mejorarás la situación si liberas al que ya tenías antes del estrés por el que está pasando.