Hola Nikolaz271,
la soja remojada no tiene por qué oler mal. ¿Durante cuánto tiempo la has tenido en remojo? ¿Hace calor en tu casa? Es lo único que se me ocurre para que la soja huela mal...
La leche tiene que quedar de un color blanco cremoso. Vamos, blanco pero no cegador
Yo la guardo en un túper de plástico, pero en cristal, como tú, también está bien. En cuanto a la conservación, depende de la temperatura de tu frigorífico: en mi nevera vieja no la dejaba nunca más de dos días, para no arriesgarme, pero con la nueva me aguanta bastante más sin problemas. Prueba a ponerla en la parte más fría.